El arsenal de la Carraca fue construido a partir de 1717 por impulso de Patiño. Su defensa se consideró prioritaria durante la Guerra de la Independencia y se rodeó de un sistema de fortificaciones que incluía las baterías de San Carlos, Santa Teresa, Santa Rosa, San Fernando, Dolores y San Ramón; además de alguna batería flotante. En 1823 defendía también La Carraca la batería del Parque (sin más datos).
Al estallar la Guerra de Independencia el arsenal de la Carraca contaba con numerosos oficiales, armamento, instalaciones militares… que supusieron una ventaja para las diferentes operaciones, desde la batalla contra la flota del almirante Rosilly, librada prácticamente frente al Arsenal, como a la hora de mantener los navíos, bombardear las posiciones enemigas frente a la Isla de León o proveer de oficiales y equipamiento a las tropas. La zona tuvo utilidad durante la guerra en todo su conjunto.
La construcción de buques en la Bahía de Cádiz viene de muy antiguo. Ya en tiempo de los cartagineses se construyeron buques que se batieron con las galeras romanas durante la primera guerra púnica. Ya dijimos que durante la dominación romana Lucio Cornelio Balbo hizo construir un arsenal donde reparar y construir embarcaciones. Entre los siglos XIV y XVI se construyeron y equiparon barcos para distintas campañas y luego para América. Felipe V visitó en 1730 los caños que había entonces en su lugar, asistiendo a la botadura del navío Hércules, de 70 cañones. Todo esto pone de manifiesto la privilegiada situación estratégica de la bahía en la que se terminó construyendo el Arsenal.
La galera era una embarcación de vela y remo. Entre las de vela latina era la que tenía la quilla más larga y calaba menos, es decir, necesitaba menos profundidad para navegar.
Abandonado el real carenero a principios del siglo XVIII por su pérdida de importancia, el gobierno de Fernando VI vio la necesidad de construir un arsenal con capacidad para fabricar buques para la reciente marina de guerra. El 3 de octubre de 1752 se decretó la construcción del hoy arsenal de la Carraca.
Un equipo de ingenieros, presidido por el marino Jorge Juan, eligió como más adecuado un terreno separado de la isla de León por los caños de la Culebra y Sancti Petri. Era un islote de fango acumulado en torno a una carraca hundida, por lo que era conocido como "La Carraca".
La construcción se realizó bajo el mando de los ministros Patiño, Riperda y Cardenal Alberoni; durante el reinado de Carlos III. El plano original es obra de Sabatini en 1777. Las primeras obras fueron la adecuación del terreno por su carácter fangoso, las naves de arboladura, los astilleros, almacenes y la fábrica de jarcias, terminando su construcción en 1791. La fecha de 1777 aparece como la de botadura del buque Hércules pero hay que matizar que su construcción había comenzado en los astilleros de Puntales. El primer buque construido íntegramente en el arsenal fue el Real Familia, también de 60 cañones. Un incendio en 1822 destruyó el arsenal, quedando inservible hasta que en 1860 se reconstruyeron algunas naves.
Las partes más importantes del arsenal son: la puerta de tierra (actualmente desplazada de su localización original), la puerta del mar, los tres diques de carenado en seco (San Carlos, San Luis y San Antonio), el Penal de las Cuatro Torres, la iglesia de Nuestra Señora del Rosario, el almacén general, los polvorines de San Francisco y Santa Lucía, el embarcadero, la enfermería, la jefatura del arsenal, el ramo de ingenieros, la vivienda del almirante y la vivienda de operarios.
Las instalaciones siguen siendo de uso militar, menos los tres diques de carenado en seco, actualmente dentro del recinto del anexo astillero de Navantia y en pleno uso; dos de ellos, el de San Carlos y el de San Antonio, mantienen su estructura original.
1. Antiguo camino de la Isla
2. Puente de madera que servía de embarcadero
3. Puerta de tierra vieja
4. Diques de carenas
5. Dique proyectado
6. Casa de bombas
7. Fábrica de jarcias
8. Diques de maderas
9. Tinglados de aserradores
10. Casillas de herramientas
11. Antiguas estancias de bueyes y acémilas
12. Antiguo horno de teja, que hoy sirve de pajar
13. Cuerpo de guardia
14. Tinglados p.ª botes y lanchas, que ya no existen
15. Secaderos para maderas, que tampoco existen
16. Baterías
17. Lavadero
18. Fogones de brea
19. Cimientos de las máquinas de fuego, que se habían principiado
20. Baños del hospital
21. Hospital con la división que se ejecutó debía servir para almacén de betunes
22. Astillero de navíos y fragatas
23. Cuartel antiguo de la infantería de Marina
24. Antigua fundición de artillería, detall de Ingenieros y Obradores
25. Obradores de Pintores y Canteros
26. Patio de Maderas proyectado
27. Gradas en construcción
28. Caño proyectado en su puente
29. Tinglado para embarcaciones menores y timones
30. Cerca proyectada para dividir el Arsenal
31. Cocinas de maestranza y marinería
32. Herreria y obrador
33. Naves de arboladuras
34. Caños para introducir las arboladuras en las naves
35. Siete naves de arboladura proyectadas
36. Dique de Arboladura
37. Puente de madera
38. Casas de habitaciones
39. Antiguas tiendas de comestibles
40. Doce almacenes de derramo, proyectados
41. Cuartel de 4 Torres
42. Actual puente de madera, que conduce al presidio de 4 Torres
43. Hospital proyectado
44. Campo Santo
45. Casas proyectadas
46. Manzana de casas que hoy sirve para Cuartel de las Palmas
47. Cuartel para presidiarios y albañiles, y tinglado de ... habitaciones
48. Estancias para bueyes y acémilas
49. Cuarteles de carpinteros y maestranza
50. Actual Colegio de Guardias Marinas y Cuartel de Tropa
51. Muelle y Puerta de tierra nueva
52. Parque de Artillería y sus obradores
53. Antigua Armeria y Cuartel de Presidiarios
54. Almacén de Recorridas
55. Almacenes Generales
56. Iglesia
57. Casas del Comandante General de la plana, y del de Ingenieros
58. Ídem del Sub. Inspector
59. Obradores, Patios y Almacén de Velas
60. Patio y Almacenes de la Veeduría
61. Almacén de betunes
62. Almacén de desarme
63. Puerta de San Fernando
64. Actual obrador de Instrumentos náuticos
65. Actual fundición de bronces y estatuero
66. Almacén arruinado que da al ángulo
67. Muelle actual de anclas
68. Ídem] proyectado
69. Casillas de Veedores
70. Caño que conduce a la nueva población
71. Muelle nuevo con puente de madera para el actual embarcadero del Arsenal
72. Cuerpo de guardia de la avanzadilla
73. Arroyo que conduce a la Ciudad de San Fernando